«Подводная лодка» 3 сезон следует за напряженной борьбой молодого экипажа подводной лодки, когда они участвуют в битве за Атлантику, пока за ними охотится одержимый командующий Королевским флотом в захватывающей игре в кошки-мышки.
Их отправляют с опасной миссией в Южное полушарие под командованием Роберта Эренберга (Франц Динда), который находит искупление и семейные узы, которые, как он думал, потерял навсегда.
Тем временем в краях нейтрального Лиссабона, где изгнанники, шпионы и преступники общаются как с союзниками, так и с врагами, Хаген Форстер (Том Влашиха) обнаруживает смертельный заговор с целью украсть состояние в награбленном во время войны золоте.
Это открытие и мрачные переживания на Восточном фронте заставляют его усомниться в своих собственных действиях и моральном пути и приводят его к темной фигуре, замешанной в заговоре, который может изменить ход войны к лучшему.
Драма впервые переносит нас в Киль на севере Германии, главную военно-морскую базу Германского рейха, и каждый исторический сюжет ведет к эпичному финалу сериала.