Когда Донателло, Микеланджело и Рафаэль возвращаются из аркады, они обнаруживают, что лаборатория Донателло в беспорядке и что Леонардо пропал. Тем временем, застряв в замерзшей тундре, Крэнг находит высококонцентрированный источник энергии недалеко от города, которого, по его мнению, будет достаточно, чтобы позволить ему сбить всю планету с ее оси, тем самым вызвав сдвиг в близости земли к Солнцу, который перевернет весь климат планеты. В то время как полярные ледяные шапки растают, тем самым освобождая Технодром, это также приведет к тому, что город погрузится в новый ледниковый период, парализуя его для завоевания Крэнга. С помощью своего гипер-двигателя, хитроумного устройства, достаточно большого, чтобы сбить Землю с ее оси, Крэнг предлагает использовать пехотинцев, чтобы транспортировать ее на поверхность планеты и собрать, пока Шреддер и Крэнг найдут таинственный источник энергии. Находясь на улице, все еще в поисках Леонардо, черепахи обнаруживают взлом на фабрике жевательной резинки Blow Hard и решают провести расследование. Внутри они узнают, что кто-то крадет бейсбольные карточки, и решают, что обязаны что-то с этим сделать для молодежи Америки. Конечно, этот кто-то оказывается двумя кем-то, Бибопом и Рокстеди. Надрав коллективные задницы черепах, они узнают, что одна из черепах пропала, и возвращаются на Технодром, чтобы сообщить об этом Шреддеру. Используя голографический плащ Крэнга, Шреддер превращает бибопа в фальшивого Леонардо и отправляет его обратно на поверхность планеты, чтобы отвлечь и сбить с толку настоящих черепах, которые отчаянно ищут настоящего Леонардо. Находясь в канализации, настоящий Леонардо пересекает подземные туннели с одним из следящих устройств Донателло, ищет источник сигнала бедствия, который он получил, пока черепахи были в видео-аркаде, и направляется за пределы города. Вернувшись в логово, Сплинтер предлагает им всем взяться за руки и попытаться связаться с духом Леонардо, но когда они это делают, то получают видение трех динозавров! Тем временем фальшивый Леонардо (Бибоп) терроризирует весь город! В гравийном карьере на окраине города Крэнг и Шреддер обнаруживают источник таинственной энергии-инопланетный корабль, проложивший себе путь из центра Земли. Микеланджело, Рафаэль и Донателло наконец догоняют фальшивого Леонардо как раз в тот момент, когда голограмма исчезает. Через несколько минут Бибоп и Рокстеди рассказывают черепахам о плане Крэнга и Шреддера сотрясти Землю с ее оси и о том, где их можно найти. Но когда черепахи прибывают в гравийный карьер, они сталкиваются с теми же тремя динозаврами из видения, которое они разделили с мастером Сплинтером в логове. Готовясь защищать их, Леонардо приезжает, чтобы познакомить их со своими новыми друзьями. Похоже, что Спега, лидер динозавров, и его товарищи-потомки группы динозавров, которые избежали вымирания миллионы лет назад, сбежав к центру Земли. С тех пор выжившие динозавры находятся на миссии по спасению исчезающих видов животных. Выполняя именно такую миссию, они повредили свой корабль и послали сигнал бедствия, который Леонардо уловил на оборудовании Донателло. Остальное-история. То есть до тех пор, пока они не узнают, что Шреддер и Крэнг украли энергетические клетки динозавра. Благодаря бибопу и Рокстеди черепахи точно знают, где их искать. И с помощью Спиги и его собратьев-динозавров они успешно срывают кажущийся безошибочным план Крэнга по завоеванию Земли.