Практикуя свои боевые искусства, Леонардо говорит Сплинтеру, что он убежден, что есть один боевой маневр, которому он еще не научил черепах. Сплинтер на мгновение задумывается, а затем соглашается научить его единственному приему, для которого нет защиты, — маневру гадюки. Однако, несмотря на то, что Леонардо был самым одаренным учеником Сплинтера, маневр гадюки, похоже, был ему не по силам. Сплинтер предполагает, что, возможно, есть какой-то скрытый страх, который мешает ему выполнить этот маневр. Леонардо оскорблен и быстро защищает свою честь, заявляя, что он ничего не боится! Сплинтер сообщает Леонардо, что он не сможет выполнить маневр гадюки, пока не столкнется лицом к лицу со своим самым глубоким, самым темным страхом и не преодолеет его. Тем временем Эйприл О’Нил сообщает о взломе дома рептилий городского зоопарка. Похоже, кто-то утащил с собой более шестисот видов змей. Донателло, Рафаэль и Микеланджело очень любопытны по этому поводу, в то время как Леонардо, кажется, заметно потрясен простым упоминанием слова: змея. Не нужно быть ученым-ракетчиком,чтобы понять, чего боится Леонардо. Итак, бродя по улицам в поисках улик к украденным змеям, черепахи проходят мимо здания Атлант-тек и замечают, что все оборудование внутри движется. После дальнейшего расследования они обнаруживают, что движение вызвано сотней змей. Прежде чем все они ускользнут, черепахи успевают поймать одну из них, надеть на нее следящее устройство и следовать за ней к тому, кто запрограммировал их на кражу. Тем временем другие черепахи с любопытством наблюдают за странным поведением Леонардо, но не связывают его со змеями. На другом конце города Эйприл и Вернон бродят по улицам по горячим следам этой истории, когда натыкаются на Пинки Макфингерса и двух его приспешников, врывающихся в магазин спортивных товаров, чтобы украсть акваланг. Все еще находясь на другом конце города, черепахи следуют за змеей с помощью следящего устройства на территорию старого Ботанического сада, который был заброшен в течение многих лет. Там на ТМНТ нападают сотни змей. Леонардо впадает в панику и не может помочь другим черепахам. Прежде чем провалиться сквозь гниющие половицы, Леонардо наконец заявляет о своем страхе перед змеями. Когда Леонардо приходит в сознание, змей и других черепах уже нет. Леонардо в затруднении. Он знает, что должен спасти других черепах, но его первая реакция-бежать, что он и делает… прямо на Эйприл и фургон новостей Шестого канала Вернона, который следовал за лимузином Пинки Макфингерс к старому Ботаническому саду. В то время как Эйприл и Леонардо обмениваются историями о том, почему они оба там, внутри Макфингерс доставляет украденное водолазное снаряжение фигуре в капюшоне, известной как Кобрато. Кобрато сообщает Пинки, что он и его люди должны использовать его, чтобы разместить тепловое устройство, построенное со всем украденным электрическим оборудованием, на дне Ист-Ривер. Кобрато продолжает рассказывать им, что он планирует активировать устройство, вызывающее повышение температуры воды и создающее тропическую атмосферу для своих верноподданных змей. Леонардо, Эйприл и Вернон следуют за пинки Макфингерсом и его приспешниками к реке, захватывают его и сдают полиции. Но не раньше, чем злодеи смогут поместить устройство Кобрато на дно реки. Эйприл проводит некоторые исследования и узнает, что Кобрато на самом деле Рудольф Кобрато, герпетолог, исчезнувший после трагического несчастного случая, связанного с экспериментом со змеиным ядом. Тем временем, убедившись, что его устройство на месте, Кобрато начинает процесс активации, в то время как Донателло, Микеланджело и Рафаэль, убежденные, что Леонардо слишком боится змей, чтобы вернуться и спасти их, придумывают свой собственный побег. По всему городу поднимается температура, но Леонардо все еще слишком боится вернуться и помочь своим братьям, пока трое маленьких детей, поклоняющихся черепахам, не назовут его цыпленком после того, как он скажет им, что ничего не может сделать. Собрав все свое мужество, Леонардо успешно пробивается сквозь змей, но сталкивается с кобрато в капюшоне, который в конце концов оказывается змеей. Используя маневр гадюки, Леонардо способен победить Кобрато, спасти других черепах, деактивировать устройство Кобрато и даже заставить неблагодарного Кобрато вернуться к своему человеческому облику.